View/Open

Author
ANI, ANGGRAINI

Date Published
10 Sep 2026

Advisor
Dr. Sarmoko, S.Farm., M.Sc., Apt.,

Subject
Farmasi

Publisher

Penyakit Paru Obstruktif Kronik (PPOK) berkaitan dengan perubahan komunitas bakteri saluran pernapasan yang dapat memengaruhi inflamasi dan eksaserbasi. Penelitian ini bertujuan mengetahui filum bakteri dominan pada pasien PPOK berdasarkan analisis metagenomik gen 16S rRNA berbasis bioinformatika serta mengkaji relevansinya terhadap penggunaan antibiotik. Penelitian ini diharapkan memberikan informasi mengenai komposisi bakteri sebagai data pendukung dalam memahami PPOK dan penggunaan antibiotik secara rasional. Lingkup penelitian maliputi analisis komunitas bakteri dari dataset sekuensing gen 16S rRNA sampel sputum pasien PPOK, dengan batasan identifikasi bakteri pada tingkat filum sehingga antibiotik tidak dapat ditentukan secara langsung berdasarkan hasil penelitian. Metode penelitian menggunakan pendekatan observaional deskriptif melalui qualiti control, filering, denoising DADA2, klasifikasi taksonomi, dan visualisasi taxa barplot. Data diinterpretasikan berdasarkan kelimpahan relatif. Hasil menunjukkan delapan filum bakteri, dengan Proteobacteria (41,38%), Firmicutes (34,89%), dan Bacteriodetes (22,02%) sebagai tiga filum dominan. Relevansi terapi menunjukkan amoxicillin, doxycycline, dan clarithromycin sebagai pilihan antibiotik oral, sedangkan co-amoxiclav dapat dipertimbangkan pada kondisi tertentu dengan mempertimbangkan sensitivitas dan risiko eksaserbasi.

URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2609150017

Keyword
COPD 16S rRNA gene bioinformatika bakteri saluran pernapasan antibiotik