View/Open

Author
RETNO, SHELVY ANGGRAENI

Date Published
25 Jun 2026

Advisor
Dr. Sarmoko, S.Farm., M.Sc., Apt.,
apt. Nisa Yulianti Suprahman, S.Farm., M.Sc.,

Subject
Farmasi

Publisher

Penyakit Paru Obstruktif Kronik (PPOK) merupakan penyakit pernapasan kronis yang pada kondisi eksaserbasi dapat memerlukan terapi antibiotik sehingga berpotensi meningkatkan seleksi terhadap bakteri resisten. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi gen resistensi antibiotik pada sampel metagenomik pasien PPOK serta menganalisis antibiotik yang menunjukkan resistensi dan mekanisme resistensinya menggunakan pendekatan bioinformatika berbasis Galaxy. Penelitian ini menggunakan dataset shotgun metagenomic publik (PRJNA1057503) yang berasal dari Jerman, terdiri atas 26 sampel pasien PPOK dan 26 sampel individu sehat sebagai kelompok kontrol. Analisis dilakukan melalui tahapan pre-processing dan identifikasi ARG menggunakan Galaxy. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ARG yang paling dominan pada pasien PPOK adalah mef(A), msr(D), tet(M), dan tet(W), yang berkaitan dengan potensi resistensi terhadap antibiotik golongan makrolida, tetrasiklin, dan β-laktam. Mekanisme resistensi yang teridentifikasi meliputi pompa efluks, modifikasi target, proteksi target dan inaktivasi antibiotik. Dengan demikian, pasien PPOK memiliki beragam ARG yang berpotensi memengaruhi efektivitas terapi antibiotik, dan analisis bioinformatika berbasis Galaxy dapat digunakan untuk memetakan profil resistome secara sistematis.

URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2606240149

Keyword
Penyakit Paru Obstruktif Kronik (PPOK) Gen Resistensi Antibiotik Resistom Metagenomik Galaxy