View/Open

Author
Salaisya, Maharani Fathehah

Date Published
21 May 2026

Advisor
apt. Nisa Yulianti Suprahman, S.Farm., M.Sc.,
Dr. apt. Anjar Hermadi Saputro, S.Farm., M.Pharm.S,

Subject
Farmasi

Publisher

Resistensi antibiotik pada Escherichia coli mendorong eksplorasi kandidat obat baru dari bahan alam. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi senyawa metabolit alga Turbinaria ornata (Turner) J. Agardh sebagai inhibitor DNA Gyrase B Escherichia coli melalui penambatan molekul in silico dan evaluasi profil toksisitasnya. DNA Gyrase B dipilih sebagai target karena sisi pengikatan ATP-nya lebih terpelihara dan lebih jarang mengalami mutasi resistensi dibandingkan subunit DNA Gyrase A yang sudah menjadi penyebab utama resistensi terhadap fluorokuinolone. Protein target yang digunakan adalah DNA Gyrase B dengan PDB ID: 5L3J dan 3G7E. Sebanyak 58 senyawa diseleksi menggunakan Lipinski's Rule of Five, dioptimasi dengan Avogadro®, ditambatkan menggunakan AutoDockTools®, dan divisualisasikan dengan BIOVIA Discovery Studio 2025 Client® dengan nilai RMSD validasi 1,209 Å. Senyawa 2,4-Bis(indol-3-ylmethyleneamino)toluene menunjukkan energi ikatan terbaik pada kedua protein (−8,91 kkal/mol pada 5L3J; −9,83 kkal/mol pada 3G7E), melampaui clorobiocin sebagai kontrol positif. Berdasarkan analisis binding site similarity dan prediksi toksisitas, Phenethylamine, 3-benzyloxy-2-fluoro-β-hydroxy- dan N-[2-[1-Isoquinolyloxyethyl]]-2-thiosulfuroethylamine dinilai sebagai kandidat paling menjanjikan dengan kemiripan residu asam amino 62,5 persen dan profil toksisitas yang relatif aman.

URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2606150014

Keyword
Turbinaria ornata (Turner) J. Agardh DNA Gyrase B Escherichia coli Penambatan Molekul Prediksi Toksisitas