View/Open

Author
Ferlyta,

Date Published
22 Dec 2025

Advisor
Marsudi Siburian, S.Si., M.Biotech.,
drh. Didik Tulus Subekti, M.Kes.,
Sekar Asri Tresnaningtyas, S.Si., M.Biomed.,

Subject
Teknik Biomedis

Publisher

Trypanosoma evansi merupakan parasit penyebab surra yang menimbulkan gangguan kesehatan serius pada hewan ternak dan berdampak pada produktivitas peternakan. Penelitian ini dilakukan untuk mengevaluasi secara komprehensif perbedaan kinerja antara metode PCR singleplek dan PCR multipleks dalam mengidentifikasi DNA T. evansi secara spesifik dan efisien. Isolat Trypanosoma diperoleh dari Balai Besar Perakitan dan Modernisasi Veteriner Bogor, kemudian diekstraksi menggunakan kit Zymo sesuai protokol standar. Proses amplifikasi memanfaatkan tiga set primer, yakni ESAG6/7, kDNA minicircle (MINI), dan kDNA maxicircle (MAXI), yang masing-masing diuji dalam rancangan singleplek maupun dikombinasikan dalam multipleks. Tahapan penelitian meliputi inokulasi isolat, ekstraksi DNA, amplifikasi berbasis PCR, pemisahan fragmen melalui elektroforesis gel agarosa, serta visualisasi menggunakan UV Transiluminator. Hasil analisis menunjukkan bahwa konfigurasi PCR multipleks memberikan performa yang lebih efisien dibanding PCR singleplek, ditunjukkan oleh waktu pemrosesan yang lebih singkat dan kebutuhan reagen yang lebih rendah tanpa mengurangi ketepatan amplifikasi. Temuan ini mengindikasikan bahwa PCR multipleks dapat dijadikan metode alternatif yang lebih praktis dan ekonomis untuk identifikasi molekuler T. evansi.

URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2601070029

Keyword
PCR Multipleks Polymerase Chain Reaction Surra Trypanosoma evansi