Penambatan Molekul dan Prediksi Toksisitas Beberapa Senyawa Pada Kenikir (Cosmos caudatus) Sebagai Inhibitor α-glukosidase Pada Diabetes Melitus Tipe-2
Diabetes melitus (DM) adalah penyakit yang disebabkan kenaikan gula darah karena terganggunya sekresi insulin sel β pankreas. DM tipe 2 memiliki penderita sebanyak 536,6 kasus di seluruh dunia pada tahun 2021. Sehingga eksplorasi tanaman herbal perlu dilakukan untuk melihat potensi sebagai kandidat antidiabetes. Salah satu tanaman herbal yang memiliki potensi antidiabetes adalah kenikir (Cosmos caudatus) yang dilaporkan memiliki aktivitas penghambat α-glukosidase. Tujuan penelitian ini adalah untuk melihat hasil penambatan molekul berupa energi ikatan bebas dan residu asam amino dari beberapa metabolit sekunder kenikir sebagai inhibitor α-glukosidase pada protein target dengan PDB ID 5NN8 serta memprediksi profil ADME, Lipinski’s Rules of Five dan toksisitas senyawa uji. Metode penelitian penambatan molekul dilakukan dengan optimasi struktur molekul menggunakan perangkat lunak Avogadro®, validasi dan penambatan menggunakan perangkat lunak AutoDockTools®, dan visualisasi hasil menggunakan perangkat lunak Biovia Discovery Studio®, SwissADME® untuk melihat profil Lipinski dan pkCSM® untuk memprediksi ADME dan toksisitas. Hasil penambatan molekul menunjukkan kompleks katekin dengan protein α-glukosidase menghasilkan energi ikatan bebas terendah dibandingkan senyawa uji lain dengan nilai -6,81 kkal/mol. Hasil Lipinski menunjukkan rutin dan quercitrin tidak memenuhi dari aturan Lipinski. Seluruh senyawa uji dapat diprediksi profil ADME dan toksisitasnya dengan senyawa asam klorogenat diprediksi memiliki toksisitas tertinggi dibandingkan senyawa uji lain.
URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2507280014
Keyword
Diabetes Melitus Penambatan Molekul Prediksi Toksisitas α-glukosidase Kenikir