Penambatan Molekul Dan Prediksi Toksisitas Beberapa Senyawa Metabolit Sekunder Buah Bit (Beta vulgaris L.) Sebagai Antivirus Demam Berdarah Dengue Bertarget Pada DENV NS5
Demam Berdarah Dengue (DBD) merupakan penyakit yang disebabkan oleh virus dengue dan telah menjadi permasalahan kesehatan global yang cukup signifikan. Saat ini belum ada pengobatan yang spesifik untuk penyakit ini, sehingga diperlukan penelitian lebih lanjut untuk menemukan agen antivirus yang potensial. Salah satu target penting dalam penelitian ini yaitu protein NS5, yang memiliki peran dalam proses replikasi virus. Beberapa senyawa metabolit sekunder seperti betalain, betasianin, betanin, isobetanin, neobetanin, asam galat, asam klorogenat, katekin, beta-karoten, betaxanthin, miraxanthin, vulgaxanthin I, vulgaxanthin II, lampranthin II, indicaxanthin, dan glisin betain telah berhasil diidentifikasi sebagai senyawa metabolit sekunder dalam buah bit (Beta vulgaris L). Penelitian ini dilakukan secara In Silico dengan menggunakan metode penambatan molekul dan uji toksisitas dari senyawa metabolit sekunder buah bit. Metode yang digunakan dalam penelitian ini mencakup pengumpulan senyawa metabolit sekunder dalam buah bit, penambatan molekul dengan menggunakan perangkat lunak AutoDock® dan uji toksisitas menggunakan situs pkCSM. Hasil penambatan molekuler SAH (S-Adenosyl-L-Homocysteine) memiliki nilai energi ikatan bebas (∆G) -9,89 kkal/mol. Sedangkan ligan uji terbaik yaitu asam klorogenat dengan nilai energi ikatan bebas (∆G) -6,31 kkal/mol. Hasil tersebut menunjukan bahwa afinitas SAH masih lebih baik dari asam klorogenat. Hasil dari visualisasi interaksi residu asam amino menunjukan senyawa lampranthin II memiliki 100% kesamaan residu asam amino dengan ligan alami dibandingkan senyawa lainnya. Hasil toksisitas menunjukan bahwa senyawa asam klorogenat dan katekin merupakan senyawa dengan toksisitas terendah. sehingga disarankan untuk dilakukannya modifikasi pada senyawa asam klorogenat untuk memaksimalkan potensi ikatan dan meminimalkan toksisitas.
URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2507090004
Keyword