Analisis Penambatan Molekul Senyawa Aktif Pegagan dan Minyak Pohon Teh Pada Kolagen
Tanaman pegagan (centella asiatica) dan minyak pohon teh (melaleuca alternifolia) memiliki senyawa aktif yang dimanfaatkan sebagai obat dan kosmetik. Senyawa aktif pegagan asiaticoside dan madecasosside, minyak pohon teh terpinen-4-ol dan α-terpineol memiliki manfaat sebagai antipenuaan, antioksidan, penyembuh luka dengan memicu produksi kolagen di dalam tubuh meningkat. Penelitian ini mengunakan metode blind docking dengan penambatan molekul berbasis AutoDock Vina dan deteksi rongga berbasis kelengkungan pada server CB-Dock2. Hasil penambatan molekul membentuk ikatan, binding affinity, cavity volume, center dan docking size. Penambatan senyawa aktif dengan reseptor menghasilkan binding affinity asiaticoside -8.9 kkal/mol, madecasosside -8.6 kkal/mol dan α-terpineol -4.6 kkal/mol berlangsung spontan dengan afinitas lebih baik dibandingkan dengan native ligand. Ikatan yang terjadi antara ligan uji dengan protein kolagen I memiliki dampak positif bagi kulit ditandai dengan terbentuknya ikatan hidrogen, hidrofobik dan elektrostatis dengan residu asam amino mengarah pada sisi aktif protein chain A. Ikatan hidrogen yang terjadi di asiaticoside 3.01-3.11 Å, madecasosside 2.84-3.19 Å, dan terpinen-4-ol 2.95 Å yang tergolong kuat dan memenuhi memenuhi kriteria ikatan hidrogen sebagai donor dan aseptor pada jarak ikatan < 3.9 Å. Dengan indikasi asiaticoside, madecasosside dan α-terpineol dapat memicu produksi kolagen dan mempercepat regenerasi pada kulit.
URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2409250227
Keyword
penambatan molekul; pegagan; minyak pohon teh; kol