View/Open

Author
May, Eva Francisca

Advisor
Marsudi, Siburian, S.Si., M.Biotech.
Dwi, Wulandari, S.Si., M.Biomed.
Muhammad, Artha Jabatsudewa Maras, S. Si., M.T.

Koleksi
Student Dissertations and Theses

Publisher

Kanker leher rahim menempati posisi keempat yang didominasi wanita di seluruh dunia. Infeksi human papilloma virus (HPV) menjadi penyebab utama kanker serviks, khususnya tipe tinggi 16 dan 18. HPV dapat dicegah pada tahap awal. Namun, bagi pasien dengan kanker stadium lanjut, vaksin terapeutik menjadi strategi pengobatan alternatif yang menjanjikan untuk memberantas HPV risiko tinggi. Penelitian ini bertujuan untuk mengatasi permasalahan kanker serviks dengan menganalisis protein E6 HPV 18 sebagai desain vaksin terapeutik. Penelitian ini meliputi analisis in vitro menggunakan sampel usap serviks, optimasi polymerase chain reaction (PCR), perbanyakan amplikon, dan sequencing. Sementara itu, metodologi analisis in silico meliputi penyelarasan mutasi deoxyribo nucleic acid (DNA) protein, filogenetik, prediksi protein, prediksi pengikatan major histocompatibility complex (MHC), evaluasi antigenisitas, toksisitas, dan alergenisitas serta konservasi epitop. Hasil penelitian ini membuktikkan filogenetik gen E6 sampel BRIN-Indonesia kekerabatan terdekatnya dengan varian Amerika. Sementara itu, filogenetik protein E6 kekerabatan terdekat sampel BRIN-Indonesia dengan varian Korea, dan Nigeria. Analsis prediksi epitop memberikan wawasan mengenai potensi target vaksin terapeutik untuk kanker serviks. Prediksi epitop sel T yang tumpang tindih dengan sel B yaitu SLQDIEITCV, LQDIEITCVY, dan CQKPLNPAEKLRHLN. Penelitian ini diharapkan dapat berkontribusi pada pengembangan strategi vaksin terapeutik yang efektif untuk keganasan HPV dan kematian terkait kanker serviks.

URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2409200105

Keyword
Gen E6 HPV Kanker Serviks Protein E6 Vaksin Terapeutik