View/Open

Author
Ahmad, Zammi Autadan Hakim

Advisor
Dr. apt. Sarmoko, S.Farm., M.Sc
apt. Nisa Yulianti Suprahman, S.Farm., M.Sc.

Koleksi
Farmasi

Publisher

Inflammasome adalah kompleks protein yang berperan dalam respon inflamasi seluler. Kukurbitasin adalah sekelompok senyawa kimia dalam keluarga Cucurbitaceae, termasuk labu dan semangka. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui aktivitas kukurbitasin terhadap penghambatan inflamasi, mengidentifikasi protein target, mengetahui energi ikatnya dan interaksi protein target dengan kukurbitasin. Penelitian ini menggunakan database NCBI dan RSCB untuk mengidentifikasi target protein dan senyawa kukurbitasin. Pendekatan docking molekuler digunakan menggunakan Autodock Tools dan DS BIOVIA untuk mensimulasikan dan memvisualisasikan interaksi antara protein target dengan native ligand dan protein target dengan kukurbitasin. Target proteinnya adalah PYD (7ALV), ASC (4IFP), dan Caspase-1 (1RWK). Senyawa yang digunakan adalah berbagai macam varian kukurbitasin yang telah dilakukan penilaian sifat fisikokimianya. Dari hasil tersebut, nilai energi ikatan terendah ditunjukkan oleh hasil docking antara 11-deoksokukurbitasin I dengan protein PYD (7ALV) yang memiliki nilai energi ikatan -7,38 kkal/mol, sedangkan nilai energi ikatan dari native ligand RM5701 yaitu -10,35 kkal/mol. Melalui DS BIOVIA, native ligand (RM5701) dan 11-deoksokukurbitasin I dengan protein PYD (7ALV) divisualisasikan dan dibandingkan. Terbentuk Ikatan hidrogen konvensional Ala228 dan interaksi alkil Ala227 dan Met661 pada keduanya. Hal ini menunjukkan bahwa kukurbitasin memiliki potensi sebagai kandidat terapi untuk mengatasi gangguan inflamasi melalui interaksi yang ditargetkan dengan protein PYD dalam inflammasome.

URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2408260028

Keyword
Kukurbitasin PYD 7ALV Inflammasome