(0721) 8030188    pusat@itera.ac.id   

Studi Bioinformatika dan Skrining In Silico Senyawa Zerumbon dan Turunannya terhadap Protein Target pada Kanker Payudara Metastasis


Kanker payudara menjadi salah satu penyakit penyebab tingginya tingkat kematian di dunia. Kanker dapat bermetastasis dan merambat ke organ-organ lain dan kanker payudara memiliki tingkat prevalensi metastasis kanker tertinggi dibandingkan kanker lainnya. Pengobatan kanker dapat berdampak pada resistensi obat dan meningkatkan risiko metastasis sehingga dibutuhkan kandidat antikanker baru yang berasal dari tanaman lempuyang gajah (Zingiber zerumbet) dengan senyawa yaitu zerumbon. Zerumbon terbukti mampu menekan pertumbuhan sel dan meningkatkan apoptosis sel. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji protein target yang potensial sebagai target aksi dari zerumbon dan turunannya terhadap metastasis kanker payudara serta menentukan turunan zerumbon yang paling potensial untuk dikembangkan dalam pengobatan kanker payudara berdasarkan skrining In Silico. Penelitian ini diawali dengan analisis bioinformatika menggunakan software Cytoscape untuk memperoleh 20 target protein potensial yang kemudian dari hasil studi literatur didapatkan satu protein target terbaik. Preparasi ligan dilakukan terhadap 20 turunan zerumbon yang telah memenuhi kriteria farmakokinetik dan Lipinski’s rules of five, kemudian dilanjutkan untuk proses molecular docking menggunakan Autodock tools 1.5.7 dan energi ikatannya dibandingkan dengan ligan alami dan obat pembanding dan turunan zerumbon dengan energi ikatan terbaik divisualisasi menggunakan Discovery Studio. Hasilnya didapatkan protein HSP90AA1 (ID PDB : 2XJX) yang digunakan sebagai protein target dan turunan 4 zerumbon (N,N-Bis[6-(1-oxo-2,9,9-trimethylcycloundeca-2,6,10-trienyl) methyl] methylamine) sebagai turunan zerumbon paling potensial dengan energi ikatan sebesar -7,52 kKal/mol, dibandingkan dengan ligan alami XJX dengan energi ikatan sebesar -9,04 kKal/mol dan novobiosin sebagai obat pembanding dengan energi ikatan sebesar -3,46 kKal/mol. Kata kunci : Kanker Payudara, Metastasis, Zerumbon, Bioinformatika, Skrining In Silico, HSP90AA1

URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2308070002

Keyword