Studi Filogenetik Bunglon Taman (Garden Lizard) Genus Calotes (Cuvier, 1817) (Squamata, Agamidae) Berdasarkan Runutan Gen Cytochrome C Oxidase Sub-Unit I (COI) Parsial
Calotes diduga memiliki permasalahan spesies kompleks, yaitu kumpulan taksa
yang anggotanya terkait secara filogenetik dan memiliki kemiripan morfologi,
akan tetapi memiliki perbedaan secara genetik, ekologi, dan reproduksi. Penelitian
spesies kompleks di Myanmar menunjukkan bahwa species Calotes htunwini dan
Calotes irawadi merupakan dua spesies baru yang terpisah dimana sebelumnya
dikelompokkan sebagai Calotes versicolor. Adapun penelitian sejenis di India
berhasil membuktikan bahwa Calotes vultousus dan Calotes farooqi juga
merupakan dua spesies baru yang telah berpisah dari Calotes versicolor.
Penelitian terhadap spesies kompleks pada Calotes di Indonesia masih sangat
terbatas. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan menganalisis hubungan
kekerabatan serta pengelompokan spesies dari genus Calotes yang diperoleh dari
Lampung Selatan (LS_1 dan LS_2), Bogor (BGR1_1, BGR1_2, BGR1_3,
BGR1_4, dan BGR2) dan Langkat (LKT), berdasarkan keanekaragaman gen
mtDNA Cytochrome Oxidase Sub-unit 1 (COI). Metode pada penelitian ini terdiri
dari beberapa tahapan yaitu pengambilan sampel, identifikasi morfologis
berdasarkan buku identifikasi, ekstraksi dan isolasi DNA, amplifikasi dan
visualisasi DNA, purifikasi DNA, perunutan nukleotida dan analisis hasil runutan
nukleotida. Berdasarkan penelitian yang telah dilakukan, diketahui jika sampel
LS_1, LS_2, BGR1_1, BGR1_2, BGR1_3, BGR1_4, dan BGR2 memiliki
hubungan genetik yang sangat dekat dengan Calotes vultuosus dari Jawa Timur.
Akan tetapi, sampel sampel-sampel tersebut justru memiliki angka jarak genetik
yang lebih tinggi dengan Calotes vultuosus dari India. Hal tersebut memunculkan
dugaan jika terdapat dua cluster berbeda antara Calotes vultuosus Indonesia
dengan Calotes vultuosus India. Sampel LS_1, LS_2, BGR1_1, BGR1_2,
BGR1_3, BGR1_4, dan BGR2 memiliki angka jarak genetik dengan kategori
sedang, dan diduga telah terpisah menjadi dua kelompok spesies berbeda dengan
sampel LKT. Sampel LKT memiliki hubungan genetik yang sangat dekat dengan
Calotes versicolor dari Vietnam.
URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2306150043
Keyword