(0721) 8030188    pusat@itera.ac.id   

“Analisis Bioinformatika, Docking, dan Isolasi Zerumbon sebagai Kandidat Antikanker Kolorektal terhadap Sisi Alosterik AKT1


Kanker kolorektal merupakan salah satu penyakit kanker dengan prevalensi terbanyak di dunia. Senyawa bahan alam dapat dijadikan alternatif dalam pengobatan kanker. Zerumbon, salah satu senyawa bahan alam, terkandung dalam rimpang lempuyang. Tujuan penelitian ini yaitu untuk mengetahui aktivitas zerumbon dan derivatnya terhadap sisi alosterik AKT1 secara in silico dan melakukan isolasi zerumbon dari ekstrak lempuyang wangi. Pencarian protein target zerumbon dilakukan menggunakan basis data NCBI, STITCH, STRING, dan perangkat lunak Cytoscape. Pencarian sifat fisikokimia senyawa menggunakan basis data SwissADME. Senyawa yang memenuhi lima aturan Lipinski dilakukan docking menggunakan Autodock 4.0. Senyawa dengan energi ikatan terendah dilakukan visualisasi interaksi asam amino, profil farmakokinetika, dan toksisitasnya secara in silico. Zerumbon diisolasi dari ekstrak lempuyang wangi menggunakan kromatografi kolom. Isolat dilakukan pemantauan menggunakan KLT, kemudian diuji kemurniannya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa protein AKT1 (kode PDB 3O96) merupakan protein paling potensial untuk dijadikan sebagai target. Zerumbon dan 17 derivatnya memenuhi lima aturan Lipinski dilanjutkan untuk dilakukan docking terhadap sisi alosterik AKT1. Derivat zerumbon 16 (4-[4-(2-Hydroxyethyl) piperazinylmethyl]) memiliki energi ikatan terendah yaitu -10,42 kkal/mol. Derivat zerumbon 16 diprediksi memiliki profil farmakokinetika yang baik dan toksisitas yang rendah, sehingga senyawa tersebut diprediksi memiliki potensi sebagai obat antikanker kolorektal. Hasil isolasi menunjukkan bahwa isolat merupakan zerumbon yang ditandai dengan Rf yang sama antara isolat dengan standar zerumbon pada pemantauan fraksi menggunakan KLT. Berdasarkan uji kemurnian menggunakan KLT dengan eluen berbeda dan LC-MS/MS diperoleh isolat yang murni. Kata kunci: Kanker kolorektal, zerumbon, docking, isolasi.

URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2306090015

Keyword