“Analisis Bioinformatika, Docking, dan Isolasi Zerumbon sebagai Kandidat Antikanker Kolorektal terhadap Sisi Alosterik AKT1
Kanker kolorektal merupakan salah satu penyakit kanker dengan prevalensi
terbanyak di dunia. Senyawa bahan alam dapat dijadikan alternatif dalam
pengobatan kanker. Zerumbon, salah satu senyawa bahan alam, terkandung dalam
rimpang lempuyang. Tujuan penelitian ini yaitu untuk mengetahui aktivitas
zerumbon dan derivatnya terhadap sisi alosterik AKT1 secara in silico dan
melakukan isolasi zerumbon dari ekstrak lempuyang wangi. Pencarian protein
target zerumbon dilakukan menggunakan basis data NCBI, STITCH, STRING, dan
perangkat lunak Cytoscape. Pencarian sifat fisikokimia senyawa menggunakan
basis data SwissADME. Senyawa yang memenuhi lima aturan Lipinski dilakukan
docking menggunakan Autodock 4.0. Senyawa dengan energi ikatan terendah
dilakukan visualisasi interaksi asam amino, profil farmakokinetika, dan
toksisitasnya secara in silico. Zerumbon diisolasi dari ekstrak lempuyang wangi
menggunakan kromatografi kolom. Isolat dilakukan pemantauan menggunakan
KLT, kemudian diuji kemurniannya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa protein
AKT1 (kode PDB 3O96) merupakan protein paling potensial untuk dijadikan
sebagai target. Zerumbon dan 17 derivatnya memenuhi lima aturan Lipinski
dilanjutkan untuk dilakukan docking terhadap sisi alosterik AKT1. Derivat
zerumbon 16 (4-[4-(2-Hydroxyethyl) piperazinylmethyl]) memiliki energi ikatan
terendah yaitu -10,42 kkal/mol. Derivat zerumbon 16 diprediksi memiliki profil
farmakokinetika yang baik dan toksisitas yang rendah, sehingga senyawa tersebut
diprediksi memiliki potensi sebagai obat antikanker kolorektal. Hasil isolasi
menunjukkan bahwa isolat merupakan zerumbon yang ditandai dengan Rf yang
sama antara isolat dengan standar zerumbon pada pemantauan fraksi menggunakan
KLT. Berdasarkan uji kemurnian menggunakan KLT dengan eluen berbeda dan
LC-MS/MS diperoleh isolat yang murni.
Kata kunci: Kanker kolorektal, zerumbon, docking, isolasi.
URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2306090015
Keyword