Studi Hubungan Kuantitatif Struktur Aktivitas (HKSA) Inhibitor Pertumbuhan HCT-116 dan Penambatan Molekul Senyawa Analog Baru Modifikasi Combretastin A-4 dan Turunan Kuinolin terhadap Protein Tubulin Colchicine
Senyawa analog baru modifikasi combretastin A-4 dan turunan kuinolin diketahui memiliki
potensi sebagai inhibitor dalam pertumbuhan sel kanker dengan menghambat proses terjadinya
pembelahan sel di fase G2/M, dengan mengikat heterodimer !/# di daerah pengikatan
colchicine. Pada penelitian ini dilakukan studi hubungan kuantitatif struktur aktivitas pada 16
senyawa dan penambatan molekul pada 5 senyawa analog baru sebagai inhibitor protein tubulin
colchicine dengan PDB ID 1SA0 dan 4O2B untuk dapat mengetahui interaksi antara ligan dan
asam amino yang berperan. Perhitungan 9 deskriptor yang mewakili parameter sterik,
hidrofobik dan elektronik dilakukan dengan perangkat lunak ORCA, Marvin Sketch, dan
molinspiration, sedangkan analisis regresi multilinier dengan SPSS 20 digunakan untuk mencari
hubungan antara variabel bebas (deskriptor molekul) dengan variabel terikat IC50. Model QSAR
terbaik yang diperoleh adalah !"# !
"#!"
= 47.530 + (15.738 × 1$%&%) + (−26.634 × 1'(&%) +
(−0.361 × 678"9:) + (−4.716 × !"#;) + (−0.400 × ;<=) + (0.287 × refracivity) dengan
kriteria statistik R=0.922; R2
=0.849;
!!"#$%&
!#'()* " = 0.9482; PRESS=0.00622;RMSD= 0.314%.
Penambatan molekul dilakukan dengan menggunakan data test set pada QSAR. Hasilnya
menunjukkan bahwa senyawa 12C memiliki potensi sebagai agen anti proliferative pada
pertumbuhan sel kanker baik dalam kondisi adanya protein stathmin (PDB ID 1SA0) maupun
tidak (PDB ID 4O2B). Penelitian ini mengindikasikan bahwa senyawa 12C merupakan senyawa
aktif potensial sebagai inhibitor tubulin colchicine.
URI
https://repo.itera.ac.id/depan/submission/SB2208300022
Keyword