Perbandingan K-mer 4 dan K-mer 6 dengan IPCA untuk Klasifikasi Taksonomi 16S rRNA Tingkat Phylum berbasis Naïve BayesTry Yani Rizki Nur Rohmah / Tirta Setiawan, S.Pd., M.Si. / Sains Data, 2026Gen 16S ribosomal RNA (rRNA) merupakan penanda molekuler utama untuk identifikasi dan klasifikasi taksonomi mikroorganisme, khususnya pada wilayah variabel V3–V4 yang memiliki kapasitas diskriminatif optimal. Namun, kompleksitas data sekuens nukleotida ini menuntut pendekatan komputasi yang e... |
Pengaruh Cumulative Explained Variance pada Incremental Principal Component Analysis terhadap Klasifikasi Naïve Bayes 16S rRNABerbasis k-merARAFI RAMADHAN MAULANA / Tirta Setiawan, S.Pd., M.Si. / Sains Data, 2026Klasifikasi taksonomi bakteri menggunakan gen 16S rRNA menghadapi tantangan dimensi data tinggi akibat penggunaan representasi fitur berbasis k-mer. Dimensi fitur yang tinggi akan membebani sumber daya komputasi serta berpotensi memicu fenomena curse of dimensionality. Penelitian ini bertujuan menga... |
Perbandingan Incremental Principal Component Analysis dan Truncated Singular Value Decomposition untuk Klasifikasi BakteriALVIA ASRINDA BR.GINTING / Tirta Setiawan, S.Pd., M.Si. / Sains Data, 2026Klasifikasi taksonomi bakteri berbasis gen 16S rRNA membutuhkan representasi sekuens DNA dalam bentuk fitur numerik agar dapat diproses oleh algoritma pembelajaran mesin. Namun, representasi berbasis k-mer berbobot TF–IDF menghasilkan ruang fitur berdimensi tinggi yang dapat meningkatkan beban... |
ANALISIS PERBANDINGAN METODE KLASIFIKASI K-NEAREST NEIGHBORS DAN NAIVE BAYES PADA DATA 16S rRNA BERDIMENSI TINGGI DENGAN REDUKSI DIMENSI MENGGUNAKAN INCREMENTAL PCA UNTUK IDENTIFIKASI CLASS TAXONOMYELIA MEYLANI SIMANJUNTAK / Tirta Setiawan, S.Pd., M.Si. / Sains Data, 2026Klasifikasi bakteri berbasis sekuens gen 16S rRNA merupakan pendekatan penting dalam bioinformatika karena tingginya dimensi dan kompleksitas data yang dihasilkan oleh teknologi Next-Generation Sequencing. Pada penelitian ini, ekstraksi fitur dilakukan menggunakan pendekatan k-mer dengan nilai k = 6... |